根據飛行數據，埃及航空公司804航班星期四上午在地中海墜毀之前數分鐘機艙內的煙冒感應警報器響起。報導航空業的“航空先驅”網站公佈的數據表明，在飛機墜毀前不久，衛生間的感應警報器響聲大作。
航空先驅的報導說，他們從“飛機通訊尋址與報告系統”獲得的有關訊息。航空公司管控人員使用這個系統下載飛行數據。數據顯示，在當地時間上午2點26分，警報器探測到衛生間的煙霧。
大約一分鐘後，另外一個航空電子設備的煙冒感應警報器響起。然後，兩分鐘後，“飛機通訊尋址與報告系統”發來的最後警報消失，顯示飛機的電子和設備艙冒煙或著火。
法國航空安全部門證實這一訊息的真實性，但是一位發言人說，“在我們還沒有找到飛機殘骸或飛行數據記錄器之前，解釋了解失事的原因還為時過早”。
埃及當局也在對有關的煙霧警報進行調查。
