沉默一段時間後中國政府終於在星期三確認，台灣非政府組織、民主活動人士李明哲“因涉嫌從事危害國家安全活動”被拘留，人權組織和觀察人士擔憂中國正在擴大對NGO活動人士的攻擊，希望當局對李明哲受到的指控提供進一步細節，否則就應立即將他釋放。
目前在台北文山社區大學工作的李明哲自3月19日從澳門入境中國大陸後就失去音訊，他的家屬、同事和台灣政府多次向中國政府詢問都未獲回音，星期三，中國國台辦發言人馬曉光在例行記者會上證實，李明哲因涉嫌從事危害國家安全活動正接受相關部門調查。
國際特赦組織東亞部主任林偉星期三在一個聲明中指出，中國當局對李明哲有關“涉嫌從事危害國家安全活動”的指控過於空泛，這可能引發對中國是否正在擴大對合法NGO活動人士攻擊的擔憂，如果李明哲遭拘留“只是單純與他合法的活動主義有關”，那麼當局應該立即、無條件將他釋放。
林偉說，李明哲因定義不明的“國家安全”理由被拘留，將使那些與中國境內NGO合作的人產生警惕，因為“當局現在針對NGO及它們合作夥伴所具有的不受監督權力，已經大到令人害怕的程度。”
美國時政評論人士史凱文在接受美國之音採訪時說，從李明哲和最近幾個與中國“危害國家安全”有關的案例，例如瑞典人權工作者彼得達林、澳大利亞學者馮崇義等境外人士被抓捕或限制離境的情況來看，中國正在擴大國家安全的範圍和定義，儘管一般境外普通民間人士到中國祇是開會而非搞活動或抗議，都有可能被認為是觸及國家安全的範圍。
史凱文猜測，李明哲被抓可能有3個原因，第一個就是李明哲的背景。他說，客觀而言，李明哲並非一般台灣公民，而是一個“關心中國民主”的台灣人，他是一個NGO工作者，而且還是前民進黨黨工，因此對中國而言，李明哲是一個“有政治色彩背景”的台灣人。其次可能與中國年初開始實施的《境外非政府組織境內活動管理辦法》有關。
史凱文說：“這個法也是中國公安部管理的，公安部是國家安全的管轄權，有可能他是因為這個原因被抓的；第3，最近新聞報導說李明哲跟中國大陸很多NGO有交流，我們不知道他到底和哪些NGO和人士交流，有可能是比較敏感和所謂的敏感人士，有可能是跟他們的案子有關。”
對於台海兩岸目前官方交流中斷的情況下，台灣應該如何在李明哲案施力或協助家屬，史凱文認為，單方面施壓較為困難，台灣政府應該透過國際社會發聲，讓北京知道人權是普世價值，任意抓捕公民是非法的。
史凱文說：“單方面施壓中國很難，但是這應該變成一個國際社會的問題。總體來說，國際社會重視民主，重視民間社會、公民社會。基於這些原則，還有人權的普世價值，整個國際社會應該強調，你這樣抓捕人是不對的，按照國際法是非法的，台灣政府可能只能基於這些倡導或行動去幫助李明哲。”
此為，史凱文也表示，中國國內有其法律程序，或許有人權律師願意協助如今自己都成為敏感人士的李明哲，不過他說，“這種法律程序都是假的”，最後是否能真正幫到李明哲他感到悲觀。
台灣“關懷中國人權聯盟”理事長楊憲宏告訴美國之音，李明哲在台灣經常參與關心中國民主運動的活動，他所做的事在全世界民主國家，包括台灣，都合乎情理法，但只有在中國會被抓。
楊憲宏說，如果中共認為這是境外反華勢力入侵，那麼兩岸關係“根本走不下去”，因為李明哲是堅持民主自由價值的2千3百萬台灣人其中一個，抓一個李明哲等於告訴全台灣人，中共是與台灣價值和全球價值為敵，因此他說，“習近平不下令放人，就是首惡。”
