台灣陸委會主委陳明通星期三（10月30日）在立法院內政委員會報告“大陸委員會報告業務概況及總預算案”後接受立委的質詢，日前剛剛在立法院完成交付一讀的《中共代理人》法案成了針對陳明通的質詢內容之一。
親民黨籍立委陳怡潔告訴陳明通說，“有關《中共代理人》法案的修法有很多台商都十分的憂心。本來你們說這個法案沒有甚麼急迫性，但是現在（急著通過了，所以）看起來沒有甚麼政治誠信，因此大家說你們欠台商一個道歉。“
陳明通說，各界都清楚中國對台灣的滲透，當然要做好管理滲透的防護網，政府部分尊重立委的提案，相關法案需要推動整合，陸委會會徵詢各方面意見。
質詢結束後陳明通對媒體說，他注意到台商關切的議題，並向台商保證說，“反中共滲透相關法規跟台商無關，請各位台商在大陸好好經商，好好賺大錢”。
分析人士認為，《中共代理人》法案之所以產生爭議，最大問題就是如何界定中共代理人。
台灣文化大學國家發展與中國大陸研究所龐建國教授說：“《中共代理人》法案最大爭議就是如何界定中共代理人。很顯然這是很難做到精細定意的說法，所以有很多人擔心，像台商、像我們這樣的學術界人士到對岸進行學術交流，很可能所有這些跟大陸的交流動作，__都有可能在《中共代理人》的寬鬆定義中被入罪。所以在這種狀態下，《中共代理人》這個議案會引起這麼大的爭議。因為它很難做清楚的界定，很容易導致誘人於罪的嫌疑。”
藍營立委指稱，《中共代理人》法案被綠營急於推進立法程序，有選舉的考量。台灣將於2020年1月11日舉行大選，屆時將選出新一任總統和新一屆立法委員。
龐建國說：“這個《中共代理人》法案其實是暗示了大陸對台灣的企圖不良，表示說大陸對台灣的任何交流在內都是一種所謂統戰的陰謀，這樣就會在兩岸議題上挑起很多敵意。對於民進黨來說，把大陸變成一個敵人，對爭取選票來說是極為有利的。民進黨的訴求就是要通過該法挑起台灣社會恐中、反中的氛圍。 “
《中共代理人》法案在台灣島內引發爭議的同時，北京也在10月30日批評蔡政府的T執政黨說，這是煽動兩岸對抗。
中國國台辦發言人馬曉光說，所謂中共代理人修法，就是白色恐怖死灰復燃，其目的在於全面煽動兩岸對抗、製造兩岸敵意，打擊持不同立場的黨派團體人士，恐嚇、懲罰參與兩岸交流的台灣民眾，牽制島內的批評輿論，完全是出於一黨一己之私，已經遭到台灣社會各界的強烈反對。
馬曉光說：“我們再次正告民進黨當局，必須懸崖勒馬。”
