佐科威以6個百分點的優勢，約多出八百萬張選票戰勝印尼前特種部隊司令普拉博沃（Prabowo Subianto）。奧巴馬指出，這一選舉結果展現了印尼人民對民主的追求。
澳大利亞國立大學印尼項目的資深專家彼得•麥考利指出，儘管敗選的普拉博沃意圖質疑選舉結果，奧巴馬的聲明卻是對選舉結果的間接支持。
麥考利說：“毫無疑問，印尼大選不是百分之百的清白。有報導稱競選雙方均有不當、舞弊和操縱行為。需要強調的是，雙方都存在這樣的行為。然而，按世界標準，這仍是一場出人意料的良好選舉。印尼選舉當局和選票統計均組織有序，選票箱也被保護得當。儘管部分地區的部分選票存在爭議，但是最好的選舉觀察人員稱選票系統中的任何過錯瑕不掩瑜，絕對不會影響整體選舉結果。”
奧巴馬重申美國印尼之間密切合作關係的重要性，包括兩國全面合作夥伴關係。奧巴馬稱期待與佐科威會晤，與其一道深化兩國關係促進共同目標的實現。
佐科威將於10月宣布就職。因而奧巴馬和佐科威可能會在11月於緬甸舉行的東亞峰會上第一次碰面。
美國印尼全面合作夥伴關係於2010年11月奧巴馬訪問雅加達期間正式啟動。雙邊關係專注於能源，安全，貿易投資，民主，人權社會，教育和環境氣候問題。麥考利稱，美國印尼關係儘管存在著分歧，但整體上是良好的：
“目前的問題是關於印尼外資控制的一些政策。不過，這都是國與國貿易投資事務中常見的拉扯，美國印尼關係在這一領域仍然良好強健。現在的問題是新任的印尼總統是否會帶來相關政策的變化，但目前沒有跡象顯示新任總統會採取除繼續深化美國印尼關係外的其他任何措施。”
奧巴馬曾試圖與在任總統尤多約諾（Susilo Bambang Yudhoyono）培養更密切的關係，作為亞太再平衡戰略的一部分。澳大利亞國立大學分析人員格雷格•費里（Greg Fealy）稱印尼之所以成為美國再平衡亞太地區的重要組成部分是因其重要的戰略位置。
費里說：“印尼是世界最大的群島國家，它跨坐印度洋太平洋之間主要海上航線以及重要貿易、軍事航線。印尼的重要性還在於其在東南亞國家聯盟（ASEAN）的主導地位。所以在東南亞地區擁有印尼支持美國各項舉措對於美國外交來說極其重要。這也給其他地區國家與美國合作帶來更好的機會。
2013年的美國人權報告指責印尼未能對安全部隊法外處決行為的指控實施透明可信的調查，並表達了對於宗教和社會少數群體缺乏保護的擔憂。費里說，印尼的人權紀錄應在新任總統執政下有所推進。
